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Ce site a pour objectif de faire découvrir les logiciels de bioinformatiques. Les Logiciels proposés ici, sont uniquement des logiciels libres et fonctionnant principalement sous système de type Linux. En effet, même si certains des logiciels qui vous seront présentés, existe aussi sous d'autres systèmes d'exploitations, comme "Windows", il faut savoir que les résultats, sont obtenus plus rapidement sous Linux. Ceci est d'autant plus vrai avec des programmes demandant beaucoup de ressources à votre ordinateur.
Notre modéle économique repose uniquement sur la participation collective d'un ou plusieurs laboratoires pour la création du logiciel. Le logiciel ainsi développé est mis sous Licence GPL permettant la diffusion libre et gratuite du logiciel à l'ensemble de la communauté scientifique.
Soutenir notre travail, c'est permettre d'offrir aux équipes scientifiques dans vos domaines, des logiciels libre de droit et gratuit. Le coût de développement d'un logiciel sera estimé selon la durée nécessaire pour sa conception. Pour cela, l'équipe réalise un planning des täches du début jusqu'à la fin de la conception du logiciel. Cela permet d'informer à quel stade se situe le développement du logiciel.
Pour des informations supplémentaires contactez-moi.
Les principaux logiciels de bioinformatiques :
- CCP4I
- EMBOSS
- Mallard
- NAST
- Seaview
- Staden
Les logiciels mathématiques/statistiques :
- R
- SciLab
Les langages de programmation associés :
- C/C++
- Java et BioJava
- perl et Bio perl
- Python et Bio Python
Pourquoi les logiciels de bioinformatiques sont optimisés sous Linux?
- On obtient de meilleur performance de calcul sur ce système
- C'est un système d'exploitation gratuit
- Il existe plusieurs distributions, donnant le choix à l'utilisateur :
- Fedora
- CentOs
- RedHat
- Open Suse
- Mandriva
- Ubuntu
- Les logiciels libres favorisent l'échange des connaissances
- Les logiciels libres sont adaptés aux demandes des équipes scientifiques, dont le code source est modifiable pour y ajouter des fonctionnalités supplémentaires
Ce travail a bien sûr un coût!
Afin de participer à la promotion des connaissances scientifiques, nous développons des programmes adaptés à vos besoins.Notre modéle économique repose uniquement sur la participation collective d'un ou plusieurs laboratoires pour la création du logiciel. Le logiciel ainsi développé est mis sous Licence GPL permettant la diffusion libre et gratuite du logiciel à l'ensemble de la communauté scientifique.
Soutenir notre travail, c'est permettre d'offrir aux équipes scientifiques dans vos domaines, des logiciels libre de droit et gratuit. Le coût de développement d'un logiciel sera estimé selon la durée nécessaire pour sa conception. Pour cela, l'équipe réalise un planning des täches du début jusqu'à la fin de la conception du logiciel. Cela permet d'informer à quel stade se situe le développement du logiciel.
Pour des informations supplémentaires contactez-moi.
